Све ћелије попут хиљаде сладоледа прскају у предивним новим "ДНК микроскопима"

Pin
Send
Share
Send

Оно што изгледа као калеидоскоп блиставог сладоледа или криж између маглице и плесне забаве из 1980-их година заправо је нешто још запањујуће: несметан и детаљан приказ тачних локација ДНК и РНК унутар живе ћелије.

Метода која је отворила врата за тај невиђени поглед унутар живих ћелија - познатих као ДНК микроскопија - усавршена је током шест година, показало је ново истраживање.

"ДНК микроскопија је потпуно нов начин визуелизације ћелија који истовремено узима и просторне и генетске информације из једног узорка," рекао је у изјави главни истраживач Јосхуа Веинстеин, постдокторски сарадник са широког института МИТ.

Ова техника чак омогућава истраживачима да тачно утврде редослед нуклеотида, "слова" која чине двоструку хеликсу ДНК и појединачни ланац РНА, унутар сваке ћелије.

Нова техника је невероватно детаљна. Упоредите ову оптичку слику (лево) ћелијске популације са истом ћелијском популацијом визуелно приказаном ДНК микроскопом (десно). Трака скале = 100 микрометара. (Кредитна слика: Веинстеин ет ал./Целл)

"Омогућиће нам да видимо како генетски јединствене ћелије - оне које садрже, на пример, имунолошки систем, рак или црева - међусобно делују и створити сложени вишећелијски живот", рекао је Веинстеин.

Током последњих неколико деценија, истраживачи су развили безброј алата који им помажу у прикупљању молекуларних података из узорака ткива. Али напори да се ова технологија удружи са просторним подацима - како би истраживачи знали где и како је уређен генетски материјал - често укључују скупе и специјализоване машине.

Нови приступ знатно олакшава процес, рекли су истраживачи. У основи, метода користи сићушне тагове - начињене од прилагођених низова ДНК, дужине око 30 нуклеотида - који се прикаче на сваки молекул ДНК и РНК у ћелији. Затим се ознаке реплицирају док у ћелији нема стотина копија. Док ове копије међусобно делују, оне се комбинују и праве јединствене ознаке ДНК, рекли су истраживачи.

Интеракције између ових ДНК тагова су кључне. Једном када истраживачи сакупе обележене биомолекуле и редоследе их, они могу да користе компјутерски алгоритам за декодирање и реконструкцију оригиналних положаја тагова у ћелији, стварајући обојену виртуелну слику узорка. Утврђивање локације сваког молекула слично је начину на који кула мобитела трокутира локације оближњих мобитела, рекли су истраживачи.

Свака тачка у овом узорку, која изгледа као смешко лице, представља појединачну ћелију. Боје означавају врсту ДНК секвенце унутар сваке ћелије. (Кредитна слика: Веинстеин ет ал./Целл)

Ова техника може помоћи истраживачима да боље разумеју различите врсте људских болести. На пример, у студији су истраживачи показали да ДНК микроскопијом могу да мапирају локације појединих ћелија рака човека у узорку. Те ознаке синтетичке ДНК могу чак помоћи научницима да пресликају локације антитела, рецептора и молекула на ћелијама тумора, рекли су.

"Користили смо ДНК на начин који је математички сличан фотонима у светлосној микроскопији," рекао је Веинстеин. "Ово нам омогућава да визуелно представимо биологију онако како ћелије то виде, а не онако како то чини људско око."

Pin
Send
Share
Send